MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 chromosome

Total Repeats: 4171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017733	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017733	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017733	TGG	2	6	4174	4179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017733	TGG	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017733	GTG	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017733	ACC	2	6	4451	4456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017733	GGT	2	6	4464	4469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017733	TTA	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017733	T	7	7	4834	4840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017733	A	6	6	4845	4850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017733	A	6	6	4861	4866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017733	TGT	2	6	4900	4905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017733	TTTTA	2	10	4924	4933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017733	TC	3	6	4969	4974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017733	AAG	2	6	5001	5006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017733	T	7	7	5010	5016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017733	ACTA	2	8	5050	5057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017733	A	6	6	5062	5067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017733	A	9	9	5112	5120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017733	A	7	7	5127	5133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017733	A	6	6	5144	5149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017733	A	6	6	5160	5165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017733	A	6	6	7125	7130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017733	AGC	2	6	7158	7163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017733	GA	8	16	7164	7179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017733	T	7	7	7189	7195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017733	AAATT	2	10	7211	7220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017733	T	15	15	7278	7292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017733	T	6	6	7322	7327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017733	GTTT	2	8	7332	7339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017733	GGT	2	6	7341	7346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017733	T	6	6	7408	7413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017733	TAA	3	9	9147	9155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017733	ATAA	2	8	9539	9546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017733	TTA	2	6	9569	9574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017733	TAA	2	6	9629	9634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017733	ATT	2	6	9648	9653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017733	CAA	2	6	9716	9721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017733	TATT	2	8	9738	9745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017733	A	6	6	9776	9781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017733	AAAG	2	8	9789	9796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017733	A	6	6	12581	12586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017733	AGG	2	6	12611	12616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017733	GCTTT	2	10	13468	13477	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017733	T	6	6	13475	13480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017733	ACC	2	6	13499	13504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017733	C	6	6	13512	13517	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_017733	T	7	7	13537	13543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017733	ATA	2	6	13547	13552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017733	TTAA	2	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017733	CA	3	6	16558	16563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017733	CTG	2	6	16579	16584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017733	AAACAC	2	12	18184	18195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017733	ATCA	2	8	22586	22593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017733	T	6	6	22935	22940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017733	CTTG	2	8	22981	22988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017733	GGT	2	6	22989	22994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017733	A	6	6	23038	23043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017733	T	6	6	23056	23061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017733	A	6	6	23081	23086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017733	TGG	2	6	23094	23099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017733	A	6	6	23100	23105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017733	A	6	6	23108	23113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017733	A	6	6	23169	23174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017733	A	6	6	23201	23206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017733	CTTTA	2	10	25320	25329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017733	GT	3	6	25368	25373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017733	A	13	13	25460	25472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017733	GTT	2	6	25534	25539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017733	A	6	6	25556	25561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017733	TTG	2	6	25590	25595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017733	TTA	2	6	25842	25847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017733	ATA	2	6	27169	27174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017733	A	6	6	27196	27201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017733	A	7	7	27275	27281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017733	TA	3	6	27295	27300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017733	T	6	6	28635	28640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017733	A	6	6	28662	28667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017733	GGTT	2	8	31723	31730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017733	TAA	2	6	40429	40434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017733	A	6	6	40439	40444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017733	AG	3	6	40449	40454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017733	TAA	2	6	41895	41900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017733	GT	3	6	44158	44163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017733	ACC	2	6	44227	44232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017733	CTT	2	6	44234	44239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017733	CTGT	2	8	44341	44348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017733	GAT	2	6	44355	44360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017733	T	8	8	44695	44702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017733	CT	3	6	44724	44729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017733	TAG	2	6	44762	44767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017733	ACTTAG	2	12	44768	44779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017733	A	6	6	44825	44830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017733	T	6	6	51802	51807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017733	TCA	2	6	51867	51872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017733	ATTAA	2	10	51962	51971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017733	TTTA	2	8	57071	57078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017733	T	6	6	57114	57119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017733	TAA	2	6	57133	57138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017733	ATT	2	6	57180	57185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017733	T	7	7	57194	57200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017733	ATT	2	6	57211	57216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017733	T	6	6	57244	57249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017733	AAAT	2	8	57283	57290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017733	TTAAA	2	10	57341	57350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017733	ACAAA	2	10	57370	57379	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017733	G	6	6	57624	57629	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017733	ATA	2	6	57630	57635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017733	AAC	2	6	57667	57672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017733	A	6	6	57696	57701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017733	TTG	2	6	57825	57830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017733	A	6	6	57851	57856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017733	AGA	2	6	57859	57864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017733	AGA	2	6	57874	57879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017733	CT	3	6	57899	57904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017733	CTTT	2	8	57918	57925	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017733	CCA	2	6	57981	57986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017733	ACC	2	6	58019	58024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017733	AAAG	2	8	58061	58068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017733	TAG	2	6	58501	58506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017733	A	6	6	58552	58557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017733	AGA	2	6	58574	58579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017733	AGA	2	6	58589	58594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017733	TGC	2	6	58615	58620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017733	AAT	2	6	58641	58646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017733	CTT	2	6	58651	58656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017733	TGA	2	6	58670	58675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017733	A	6	6	58735	58740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017733	CTA	2	6	58756	58761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017733	GATGTG	2	12	58764	58775	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017733	AGCCAA	2	12	58841	58852	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017733	AAAG	2	8	58904	58911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017733	ATA	2	6	58944	58949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017733	ATA	2	6	59055	59060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017733	CT	3	6	59078	59083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017733	TAG	2	6	59094	59099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017733	T	7	7	59279	59285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017733	CAA	2	6	59425	59430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017733	A	6	6	59499	59504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017733	AG	4	8	59507	59514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017733	AAG	2	6	59521	59526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017733	A	6	6	59531	59536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017733	A	6	6	59565	59570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017733	GAGC	3	12	59598	59609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017733	T	6	6	59648	59653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017733	TTA	2	6	59680	59685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017733	GAC	2	6	59710	59715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017733	A	6	6	59739	59744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017733	TTG	2	6	59828	59833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017733	T	6	6	59998	60003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017733	AGA	2	6	60037	60042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017733	CTT	2	6	60193	60198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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